AI poprawił pracę edytora genomu, przepowiadając wyniki
Source:
Z edytorem genomu CRISPR-Cas9 już całkiem dobrze nauczyli się posługiwać. Jednak przy dość dobrej znajomości technologii i zasad jej działania, wynik, który będzie w trakcie edycji, nie zawsze przewidywalny. Wynika to z cech samego procesu edycji i to właśnie jego wynik nauczył się przewidywać sztuczna inteligencja, jeszcze bardziej poprawiając skuteczność metody edycji genomu.
Na początek chciałbym wyjaśnić, w czym tkwi główny problem. O dziwo, bezpośrednio edytor genomu tu prawie nic wspólnego. Białko Cas9 w tym przypadku pełni funkcję ostrza i wycina odpowiedni składnik genomu. Ale dalej na "puste miejsce" trzeba wstawić inny składnik. Używa macierzy DNA, która, jeśli się wyjaśnić prostym językiem, działa jako "dawcy" materiałów. Proces ten nosi nazwę naprawa DNA. Istnieją inne systemy, które działają na podobnej zasadzie, w przypadku braku macierzy DNA, ale to właśnie w nich tkwi problem: po ich pracy na miejscu wymiany materiału genetycznego mogą zostać skreśleń (z grubsza mówiąc, brakujące odcinki). Wynik tych zabiegów wcześniej można było obliczyć tylko empirycznie.
Jak przekazuje redakcja czasopisma "Nature", grupa naukowców z Massachusetts Institute of Technology (MIT) opracował program oparty na sztucznej inteligencji, która oblicza wynik zmiany genomu. AI jest w stanie powiedzieć, jaka sekwencja powstaje w miejscu interwencji po edycji, a także co najmniej w 50% przypadków informuje o tym, czy po zakończeniu operacji pozostać skreśleń. Ponadto, jeśli użyć AI do przewidywania wszystkich etapów, dokładność przewidywania można zwiększyć do 5-11%, a to bardzo dobry wynik.
Aby nauczyć SI przewidzieć wynik ingerencji w genom, naukowcy stworzyli bibliotekę z 2000 prowadnic RNA dla Cas9 (właśnie RNA określa wiewiórkę, gdzie trzeba wyciąć molekułę). Dalej z nich wybrano 14, które mogą po odszkodowań powodować pojawienie się dodatków nukleotydów, a następnie AI wybrałem te, które najczęściej doprowadzały do błędów odszkodowań. Na podstawie tych danych została zbudowana "model postępowania, który już był używany i dla innych operacji. Naukowcom już udało się skutecznie i bez objawów ubocznych edytować mutacji w komórkach z zespołem Niemieckiego-Пудлака i chorobą Менекса.
Ten i inne wiadomości można omówić w naszej
Bardziej:
Koronawirusy zmutowane w 30 nowych szczepów
podczas Gdy коронавирусный apokalipsa powoli, ale nieuchronnie staje się rutyną, sam wirus SARS-CoV-2 w dalszym ciągu rozwijać. I, niestety, dobry jest. Jak pisze , powołując się na South China Morning Post, nowe badania pokazują, że wirus SARS-CoV-2...
W USA uznali, że urządzenie WENTYLACJI mechanicznej umiera 88% pacjentów z коронавирусом
Gdy na świecie szaleje koronawirusy, który prowadzi do zapalenia płuc i zabija ludzi, jedynym rozwiązaniem będzie wzmocniona leczenie. Jeśli się tego nie robić, ofiar będzie bardzo dużo. Na dzień dzisiejszy do ciężkich pacjentów jest tylko jedno rozw...
Czy może transfuzji osocza krwi leczyć koronawirusy?
Zwykle szczepienie stanowi wprowadzenie do organizmu osłabionych lub zabitych mikroorganizmów (wirusów), przeznaczonych do tworzenia trwałej odporności na możliwe przyszłe choroby zakaźne — to jest do wydzielania przeciwciał. Ale co zrobić, jeś...
Nowości
Nano do leczenia chorób po raz pierwszy wprowadzono w oko ludzkie
Naukowcy z Instytutu inteligentnych systemów Maxa Plancka w Stuttgarcie jeszcze na krok zbliżył się do tworzenia микроботов do leczenia różnych chorób. W tej chwili są już z powodzeniem przetestowali miniaturowych robotów, które m...
Obfite rybna dieta pomoże w walce z astmą
badanie Kliniczne, przeprowadzone przez Uniwersytet w La Тробе, wykazały, że spożywanie ryb — łososia, pstrąga i sardynki — w ramach zdrowej diety może zmniejszyć objawy astmy u dzieci. W trakcie międzynarodowego badania okazało s...
Czynniki genetyczne otyłości chronią przed cukrzycą
Niektóre genetyczne wariacje związane z otyłością, mogą chronić przed cukrzycą typu 2, zawału serca i udaru mózgu, donoszą naukowcy. Są przekonani, że miejsca na ciele, gdzie organizm gromadzi tłuszcz na brzuchu lub w okolicach wą...
Jest bezpieczny, czy CRISPR na 100 procent? Naukowcy mówią, że nie, ale oferują rozwiązania
Edytowanie genomu za pomocą CRISPR-Cas9 — nie tylko obiecujące narzędzie do badania, ale i klucz do opracowania nowych metod leczenia, o czym możemy się dosłownie na dniach. Ale czy istnieje niebezpieczeństwo w stosowaniu CR...
Opracowana szczepionka przeciwko udaru mózgu i innych schorzeń naczyniowych
tworzeniu się skrzepów krwi jest przyczyną różnych (często śmiertelnych) choroby. Oczywiście, istnieją środki terapii zakrzepicy, ale z regularnego przyjmowania mają jedną bardzo przykra właściwość: rozwój krwawienia. Na pomoc moż...
W MIT wymyślili, jak umieścić produkcja микроботов na strumień
Nowoczesne roboty nie tylko uczą się nowych sztuczek w stylu , ale i idą na drodze miniaturyzacji. Już wielokrotnie na łamach naszego serwisu pisaliśmy o różnych микроботах, zdolnych do pracy wewnątrz naszego organizmu w celu moni...
Mądra powierzchnia odbija wszystkie zarazki i wirusy. Oprócz tych, które wpłacisz do listy wyjątków
niezależnie od sterylnej ani była środa i jakimi środkami dezynfekcji jesteśmy ani posiadali, na każdej powierzchni, w każdym przypadku będą gromadzić się bakterie chorobotwórcze i wirusy. Tak, jeśli nie możemy w żaden sposób na t...
Naukowcy wychowują sieć neuronową z ludzkich komórek macierzystych
Nauka układu nerwowego zwierząt wyższych — bardzo trudne zadanie. Szczególnie jeśli chodzi o badaniu ludzkiego mózgu. Uzyskać wymagany materiał okazuje . Jednak w ostatnim czasie нейрофизиологи dość dobrze nauczyli się obcho...
Jeden z nich na podstawie hybrydowego białka pomaga skutecznie leczyć rany
Regeneracyjne zdolności naszego organizmu są dość duże i w wielu urazach gojenie odbywa się praktycznie bez szkody, a nowe tkaniny albo niczym się nie różnią od starych, albo całkiem dobrze znoszą ich funkcji. Jednak zdolność do s...
Środek został opracowany przez immunoterapii chorób neurodegeneracyjnych
Już od dawna wiadomo, że przyczyną rozwoju wielu procesów neurodegeneracyjnych mózgu (w tym choroby Alzheimera) jest gromadzenie się białka amyloidu, co powoduje powstawanie tak zwanych płytek amyloidowych i pogorszenie funkcji po...
Ferromagnetyczne pływające roboty — nowe słowo w diagnostyce i leczeniu chorób
Mikroskopijne roboty, które mogą poruszać się wewnątrz naszego organizmu już dawno przestały być czymś niesamowitym i, prawdopodobnie, prędzej czy później znajdą swoje zastosowanie w medycynie. Ale interesujące jest co innego: wsz...
Zaprojektowany, mały aparat do operacji w żyłach i tętnicach
Teraz nowoczesna chirurgia już praktycznie nie obywa się bez użycia kamer podczas operacji. Odnosi się to szczególnie do zabiegów chirurgicznych na naczyniach, które mają bardzo małej średnicy. Tutaj bez nadzoru nie może się obejś...
Ogłoszono laureatów nagrody Nobla w dziedzinie medycyny
nagroda Nobla jest jedną z najbardziej pożądanych nagród dla każdego naukowca. Oprócz oczywistego uznania akademicy — to jeszcze i bardzo dobre wynagrodzenie. Ponadto, laureaci nagrody nobla często nie tylko wpisują swoje im...
Bakteryjne białko мимикрирует pod DNA, aby przebić się przez obronę komórki
Infekcji сальмонеллой, często spowodowane używaniem lub obsługą недоваренного mięsa lub jaj, dotyczą około 100 milionów osób rocznie na całym świecie. Cierpienie, spowodowane infekcją — skurcze brzucha, gorączka i biegunka — są w...
W Rosji tworzy SI na podstawie big data dla postawieniu diagnozy
Duże dane (lub big data) w ostatnim czasie coraz częściej znajdują zastosowanie w wielu różnych dziedzinach. Mówiąc prościej, big data – to ogromny wachlarz nieuporządkowanych danych, które można wykorzystać do tych lub innych cel...
Nowy skok test za 20 minut wykaże przyczynę bólu w sercu
Do diagnostyki różnych chorób, istnieje masa sposobów. Ale zdarzają się sytuacje, kiedy проявившийся objaw nie mówi zupełnie o niczym: to może być niewielki skurcz mięśni, jak i oznaką rozwoju poważnej choroby. Jednym z najbardzie...
Uszkodzenie rdzenia kręgowego – nie wyrok
Cztery lata temu młoda amerykanka Kelly Thomas obudziłam się w jednym ze szpitali na Florydzie i zdałam sobie sprawę, że wypadek samochodowy odlaczenie ma możliwość chodzić. Ale bardzo aktywna do tego momentu studentka, podejmując...
Naukowcy przywrócili парализованному człowiekowi zdolność chodzenia
Jednym z najbardziej przerażających obrażeń dla każdego człowieka jest paraliż. Stan, w którym następuje utrata aktywności ruchowej jednej, kilku kończyn lub całego ciała. Ten problem może wystąpić w życie różnych przyczyn i nie z...
Edycja RNA może stać się kolejnym etapem rozwoju CRISPR
Naukowcy z prestiżowego Salk Institute poinformował, że udało im się stworzyć mapę struktury molekularnej enzymu CRISPR, który pozwoli naukowcom bardziej precyzyjnie manipulować funkcji w komórce. W ciągu ostatnich kilku lat CRISP...
Eksperymentalna immunoterapia HIV przeszedł pierwszy etap testów bezpieczeństwa
Wstępne wyniki pierwszej fazy badań klinicznych wykazały bezpieczeństwo i tolerancję terapii komórkowej obejmującej ekspresję T-komórek ex vivo i późniejsze wdrożenie wirusem HIV ludzi, którzy wcześniej byli leczeni za pomocą tera...
Uwaga (0)
Ten artykuł nie ma komentarzy, bądź pierwszy!