Genético "arca de noé" salvará 66 000 especies de

Un consorcio internacional formado por más de 50 instituciones, en estos días se ha anunciado un ambicioso proyecto de recaudación de alta calidad de las secuencias del genoma de 66 000 especies de vertebrados de todo el mundo, incluyendo mamíferos, aves, reptiles, anfibios y peces. El proyecto tendrá un costo de 600 millones de dólares, pero las proporciones de él, por así decir, de la biblia.

El Proyecto de los genomas de los vertebrados (Vertebrate Genomes Project, VGP) organiza el consorcio llamado Genome 10K, o G10K. Como su nombre indica, este grupo inicialmente previsto de secuenciar los genomas de no menos de 10 000 especies de animales vertebrados, pero ahora, gracias a los grandes éxitos y reducir el costo de la tecnología de secuenciación de genes, G10K, decidió subir la apuesta y secuenciar tanto de los machos como de las hembras de cada uno de aproximadamente el 66 000 especies en la Tierra.

¿Qué especies terrestres se pueden salvar si se pierda el 99%?

Los Creadores del proyecto han anunciado nuevas metas en el momento de la conferencia de G10K de 2018, que se llevó a cabo en la Universidad de rockefeller en nueva york. El proyecto constará de más de 150 expertos de 50 instituciones y de 12 países.

Junto con el anuncio presentaron 14 nuevos de alta calidad de los genomas de las especies, en representación de las cinco clases de vertebrados, incluyendo los genomas grande de herradura murciélago, el lince canadiense, platypus, el colibrí de ana, loro какапо (de los cuales sólo quedan 150), la tortuga del desierto hood, хвостатой червяги (extraña anfibios, similar al de la serpiente) y анабаса. Estos 14 genomas y otros, reunidos en el marco del proyecto, estarán disponibles para los científicos, para los fines de la investigación.

VGP — no es sólo la secuenciación de los genomas de los animales. Como el proyecto del genoma humano (Human Genome Project), es una empresa definitivamente realizará los avances en la gran calidad secuenciación y ensamblaje del genoma, lo que dará lugar a una disminución de costos y la reducción de errores. El proyecto también se ocupará de cuestiones importantes de la biología y la medicina, por lo que será útil para el estudio de la evolución de la genómica y консервационной de la biología. Catálogo completo de las especies de vertebrados de la Tierra podría servir como protección de extinción y para la prevención de la extinción, así como para la posible recuperación de las especies en el futuro.

Oliver Райер, co-fundador de G10K y director del Instituto de консервационных de la investigación en el zoológico de san diego, dice que el VGP tiene el potencial de transformar todas las esferas de la biología". Él cree que los científicos pueden entender las causas de la extinción, así como a la aparición de mutaciones nocivas, la endogamia y los cuellos de botella. Las personas tendrán la oportunidad de mantener su herencia biológica.

Cuando G10K se inició hace 10 años, sus miembros no tenían ni idea de cuánto tiempo se necesita para secuenciar los genomas de calidad suficiente para ocuparse de la ciencia y que estaba disponible.

"Estoy muy emocionado, porque ahora tenemos todas las palancas para hacer las cosas bien", dice david Хаусслер, co-fundador de G10K y director del Instituto de genómica en la universidad de california en santa cruz. "Ahora no tenemos ninguna razón para no hacerlo".

Para crear alta calidad de ensamblados global del genoma, el equipo de VGP da preferencia a la larga registros", que la corta, es decir, cuando la tecnología de secuenciación producen largos fragmentos de datos genéticos. De ellos, más fácil sería recoger una secuencia de adn en cromosomas enteros. En lugar de trabajar con un rompecabezas de millones de piezas separadas, largas de grabación darán lugar a un rompecabezas de miles de tales.

Además, los científicos se abstendrán de la combinación de los hombres y mujeres de cromosomas en un genoma de una práctica que lleva a demasiado grandes errores. En lugar de ello, el comando será recoger paterna y materna en el adn de los individuos en el proceso de фазирования. Cada clase se reunirá por separado y de manera que el trabajo no era necesario repetir en el futuro.

"tan esperados avances en la secuenciación permiten iniciar la secuenciación de adn, literalmente, de novo (desde cero)", dicen los científicos.

Y, de hecho, no hace mucho le costó millones de dólares y requería muchos años para completar el genoma incluso un animal. Las nuevas tecnologías de secuenciación en breve le permitirán crear el genoma completo de una semana, dice adam filippi, el representante de la asamblea G10K. En la actualidad, la secuenciación de adn del nuevo tipo de la cuesta del orden de 30 000 dólares.

Las Nuevas secuencias de genomas se almacenarán en una base de datos Genome Ark (el"Arca"), digital abierta genomas.

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