En el futuro no vamos a editar el genoma. Vamos a crear un nuevo

Fecha:

2018-07-23 22:55:08

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Desde entonces, como los sumerios por primera vez quisieron tomar una cerveza, y fue hace miles de años, el Homo sapiens tuvieron estrechas relaciones con Sacharomyces cerevisae, одноклеточными setas, más conocidos como la levadura de cerveza. Gracias a la fermentación de la gente podría utilizar este microscópico de vista de sus objetivos. En nuestros días, las células de levadura producen etanol y la insulina, ellos ponen los experimentos en los laboratorios.

Esto no significa que S. cerevisiae, ya no se puede mejorar – en todo caso, en opinión de jeff Бойке. El director del Instituto genéticos de sistemas de la universidad de nueva York Бойке dirige un equipo internacional de cientos de personas, con el fin de sintetizar 12,5 millones de letras que componen el genoma de las células de la levadura.

En la práctica, esto significa la progresiva sustitución de cada cromosoma de la levadura – y los 16 – química del sintetizador de adn. Бойке y sus colegas de casi diez instituciones desmontan el genoma de la levadura y permiten a los científicos mezclar sus genes a su entera discreción. Finalmente sintético de levadura – Sc2.0 – se ajustarán totalmente.

"dentro De los próximos 10 años, la biología sintética se producen todo tipo de conexiones y materiales con los microorganismos", dice Бойке. "Esperamos que nuestros levadura jugarán un rol importante".

Piense en este proyecto como algo como el primer coche de henry ford – montado con las manos y único en su clase. Un día, sin embargo, estaremos muy заурядно diseñar genomas en las pantallas de los ordenadores. En lugar de diseñar o editar el adn de un organismo, sería más fácil simplemente imprimir una copia nueva. Imagine diseño de algas productoras de combustible; безотказные órganos; воскрешенные вымершие tipos.

"yo Creo que puede ser más grande que la espacial o la revolución informática", dice george church, que estudia el genoma en la universidad de harvard escuela de medicina.

Anteriormente, los científicos ya sintetizaron genéticos instrucciones para controlar el virus y bacterias. Pero las células de levadura эукариотны, es decir, guardan sus genomas en el núcleo y se unen en los cromosomas, como las personas. Sus genomas también mucho más.

Y esto es un problema, porque sintetizar el adn no es tan barato como describir. El genoma humano hoy en día se puede secuenciar por 1000 dólares, y el precio se reduce constantemente. Pero para reemplazar cada letra de adn de la levadura, Бойке necesitará de 1,25 millones de dólares. Agregue el costo de trabajo y de los cálculos el costo total de un proyecto.

Junto con Черчем y otros Бойке dirige GP-write), una organización constituida por los estudios internacionales, que deben reducir el costo de diseño, desarrollo y pruebas de los genomas en mil y mil veces por los siguientes diez años. "Nos encontramos con todo tipo de problemas como la vista, y la biología, en gran medida puede ayudarnos en este planeta", dice. "Pero sólo si nos bajaremos los costos".

«de Abajo hacia arriba»

El nombre de ronald davis de la universidad de standford, por primera vez, sugirió la posibilidad de la síntesis del genoma de la levadura en la conferencia en el año 2004. Sin embargo, en ese momento Бойке no veía en este sentido. "¿Por qué alguien tendría que hacerlo?", — eso pensaba entonces.

Pero Бойке llegó a pensar que la fabricación del genoma de la levadura puede ser la mejor manera de entender el cuerpo. Sustituyendo cada parte, usted será capaz de saber qué genes son necesarios, y sin ningún organismo puede vivir. Algunos de los miembros del equipo se llama esta idea de "construir, para entender".

"Es otra manera de entender cómo se organizan los seres vivos", dice leslie mitchell, honrado trabajador de laboratorio de la universidad de nueva york y uno de los principales desarrolladores sintético de levadura. "Nos enteramos de que los vacíos en nuestro conocimiento existen, aplicando el enfoque de «de abajo hacia arriba» en la genética".

Joel Бейдер, информатик de la Universidad de johns hopkins, desarrolla un software que permite a los científicos ver el cromosoma de la levadura en la pantalla y realizar un seguimiento de las versiones a medida que van cambiando, como si en la diversidad de Google Docs. En el año 2008, para hacer el adn, Бойке lanzó un curso de pregrado en la universidad bajo el nombre de "Construir el genoma" (Build a Genome). Los estudiantes tenían que aprender básica de la biología molecular, recogiendo continua de cinta de 10 000 letras de adn, que tuvieron que viajar en el proyecto de creación de sintético de levadura. Poco después de un par de instituciones de china se han unido al proyecto, y detrás de ellos se han subido por los ingleses, australianos y japoneses.

"distribuimos los cromosomas individuales de los equipos, como capítulos de libros, y ellos son libres de decidir qué hacer con ellos, pero así que es 100% correspondía a nuestros objetivos", dice patrick kai, sintético, el biólogo de la Universidad de manchester, el coordinador internacional del proyecto con la levadura.

los Siguientes pasos

Бойке y su equipo tomó ocho años para que finalmente tuvieron la oportunidad de presentar su primera totalmente de un cromosoma artificial de levadura. Desde entonces el proyecto se ha acelerado. En marzo del año pasado, de más de cinco sintéticos de los cromosomas de la levadura se describe en la publicación de artículos en Science, y Бойке dijo que los 16 cromosomas en la actualidad están dispuestos en un 80 por ciento. Estos esfuerzos han permitido recoger la mayor cantidad de material genético, nunca синтезированного y, a continuación, fusionada.

Ha Ayudado el hecho de que el genoma de la levadura fue extremadamente resistente a las visiones y a los cambios en el comando. "Probablemente, el mayor avance es lo que puede atormentar el genoma como un todo, y la levadura se acaba de reír", dice Бойке.

Бойке y sus colegas no sólo han sustituido natural en el genoma de la levadura sintética. "Simplemente hacer una copia sería una tontería", dice church. EnEl adn de este organismo también pusieron moleculares espacios en blanco, como si invisibles de las brechas en acero con anillos de oro. Esto les permitió mezclar los cromosomas de la levadura "como una baraja de cartas", como dice kay. Este sistema, que ahora se conoce como SCRaMbLE (synthetic chromosome recombination y modificación de by LoxP-mediated evolution).

El Resultado es de alta velocidad de la evolución, la labor de las fuerzas de la persona: millones de nuevas cepas de levadura con diferentes propiedades, se puede probar en el laboratorio y encontrar la aplicación en la medicina y la industria. Mitchell pronostica que el Sc2.0 con el tiempo desplazara el resto de la levadura en los laboratorios científicos.

Definitiva de la herencia de un proyecto de Бойке puede ser la solución, qué genoma sintetizar de la siguiente manera. Grupo GP-write originalmente se pensaba que la creación de un genoma sintético de una persona puede convertirse en un "abrumador". Pero algunos de la bioética han cuestionado y cuidadosamente, criticó este plan. Бойке subraya que "no se va a hacer un proyecto destinado a la creación del hombre con el genoma sintético". Es decir, no de diseño de la gente.

Pero si descartar las consideraciones éticas, la síntesis completa del genoma humano, que es 250 veces mayor que el genoma de la levadura, deseable con la aplicación de los métodos modernos. También, estos esfuerzos no obtienen financiación. El trabajo Бойке con la levadura fue financiado por la national science foundation y otras instituciones académicas, pero esta grandiosa iniciativa GP-write no atrajo a un gran apoyo, además de la inicial de la donación de 250.000 dólares de la empresa de informática de Autodesk. Compare esto con el Human Genome Project, que ha recibido más de 3 mil millones de dólares de los estados unidos como de financiación.

"Esto es una revolución, que no queremos dormir", dice church. "Si el gobierno federal y todos los 50 estados no desean hacer, cosecharemos lo que sembramos. Nos quedaremos atrás".

Mientras tanto, el trabajo continúa, base por base. Entre las portadas de revistas y fotos de grupo Бойке almacena una cita en la puerta de su gabinete, que se atribuye a la genética teodosio Добжанскому: "Nada en biología tiene sentido excepto a la luz de la evolución". Qué grandioso no fue un proyecto de Sc2.0 – incluso si la habría llevado a la síntesis del genoma del ratón, o la creación de cerdos para el trasplante de órganos a la gente es la gente guiarán esta evolución en marcha. Sc2.0 puede convertirse en el segundo más importante logro, a la que llevó a la levadura. Después de la cerveza.

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