उपकरण CRISPR में महारत हासिल है, तीन नए गुर

तारीख:

2018-07-19 22:20:20

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CRISPR, जीन संपादन सुपर हीरो बन जाते हैं, एक थोड़ा और अधिक शक्तिशाली है । पिछले सप्ताह के विज्ञान में प्रकाशित किया गया था, तीन अध्ययन में, जो एक प्रमुख प्रयोगशालाओं में प्रस्तुत दुनिया भर से नवीनतम परिवर्धन के लिए इस तकनीक को परिवर्तित करने, संपादक जीन जासूसी वायरस या उत्सुक इतिहासकार जो retells इतिहास सेल के डीएनए में है । की तरह CRISPR, नई तकनीक मिल गया मजाकिया परिवर्णी शब्द: कैमरा, DETECTR, और शर्लक. एक अचानक फट के अनुप्रयोगों के CRISPR स्पष्ट रूप से पता चलता है कि वैज्ञानिकों का अध्ययन किया है, नहीं सभी संभावित अनुप्रयोगों के लिए इस तकनीक है ।

करने के लिए बारी CRISPR एक multitool, वैज्ञानिकों था करने के लिए सुई धागा: कैमरा, सेलुलर मॉड्यूल, का उपयोग करता है के छल्ले डीएनए के इतिहास को पढ़ने के लिए की कोशिकाओं – उदाहरण के लिए, जानने के लिए एंटीबायोटिक दवाओं के बारे में या विषाक्त पदार्थों के साथ ।

शर्लक, इसके विपरीत द्वारा, के लिए जोड़ा गया है "बलि" के अणुओं है कि शाही सेना में कटौती कर रहे हैं की उपस्थिति के डीएनए वायरस या कैंसर पैदा करने के लिए एक सकारात्मक संकेत है. यह ही प्रकट होता है के रूप में एक नीले रंग की लाइन पर कागज की पट्टी के रूप में, गर्भावस्था परीक्षण है.

"यह सब पता चलता है, बहुत ही रचनात्मक तरीके से लोगों द्वारा इस्तेमाल किया पाने के लिए पर काम करने के लिए खोजों के क्षेत्र में CRISPR और बनाने के लिए इन सिंथेटिक रास्ते कहते हैं," डॉ डेव जंगली, एक प्रोटीन इंजीनियर कैलिफोर्निया विश्वविद्यालय, बर्कले, अनुसंधान में शामिल नहीं है.

सेलुलर रिकॉर्डर

ब्लैक बॉक्स विमान के कर रहे हैं के लिए एक मूल्यवान संसाधन जांचकर्ताओं जब उड़ान गड़बड़ा जाता है । इसी प्रकार, वैज्ञानिकों का लंबे समय के लिए आशा व्यक्त की आविष्कार सेलुलर समय मशीन है, जो दस्तावेजों की घटनाओं के जीवन में सेल खुराक विकिरण फटने दवाओं के मुकाबलों आंतरिक अशांति की ओर जाता है कि स्वास्थ्य की गिरावट के सेल है ।

क्या हो सकता है की तुलना में बेहतर करने के लिए इतिहास का अध्ययन कोशिकाओं के डीएनए में है?

डॉ डेविड लियू के हार्वर्ड विश्वविद्यालय का लाभ ले लिया है की क्षमता के CRISPR के लिए सही ढंग से कटौती डीएनए और विकसित की एक "आणविक इतिहासकार" के नाम से (CRISPR-मध्यस्थता एनालॉग बहु-घटना रिकॉर्डिंग उपकरण).

यहाँ है कि यह कैसे काम करता है. शुरुआत के लिए, वैज्ञानिकों बदलने गाइड CRISPR अणु – "गाइड" शाही सेना में बैक्टीरियल कोशिकाओं के लिए, आग के बाद केवल ट्रिगर खींचने के लिए: मान लीजिए इनपुट के एक एंटीबायोटिक या अन्य रासायनिक हमला है । सक्रियण के बाद की गाइड आरएनए Cas9 प्रिंट, कैंची CRISPR लक्ष्य स्थान है । बिना गाइड आरएनए नहीं होगा कटौती.

इसके अलावा करने के लिए संशोधित CRISPR प्रणाली, टीम भी दिया कोशिकाओं को दो अतिरिक्त टुकड़ा के डीएनए में इनकोडिंग परिपत्र डीएनए प्लाज्मिड कहा जाता है. आम तौर पर, सेल व्यक्त दो plasmids के साथ निरंतर गति है । लेकिन एक बार सक्रिय गाइड आरएनए, यह (और Cas9) में चला जाता है में से एक के लिए plasmids और उसे छोड़ रहा है, अन्य अछूता है.

इसलिए, वैज्ञानिकों आसानी से कर सकते हैं को मापने के अनुपात दो plasmids. इस प्रणाली का उपयोग कर, शोधकर्ताओं जानने के लिए सक्षम थे कि सेल के संपर्क में है टेट्रासाइक्लिन, एक ज्ञात एंटीबायोटिक है ।

पहली बार इस प्रणाली के काम के साथ ही बैक्टीरियल कोशिकाओं. लियू और उनकी टीम फिर से विकसित एक दूसरी तकनीक के कैमरे का उपयोग करता है कि एक संशोधित Cas9. होने के बजाय कटौती करने के लिए लक्ष्य जीन, इन कैंची एक विशिष्ट पत्र खोजने के डीएनए और दूसरे को बदलने के लिए.

के रूप में पहले, इस प्रणाली को सक्रिय होता है के जवाब में ही कुछ संकेतों यौगिकों, पोषक तत्वों, प्रकाश या यहां तक कि संकेत अणु कोशिकाओं में, इस तरह के रूप में उन लोगों के कैंसर के साथ जुड़े. रिकॉर्डर रिकॉर्ड ही नहीं की उपस्थिति का संकेत; पढ़ने का प्रतिशत डीएनए पत्र है कि प्रतिस्थापित किया गया है, टीम भी निर्धारित कर सकते हैं अपने अवधि और शक्ति.

के विपरीत, सेलुलर रिकार्डर की पिछली पीढ़ी प्रणाली लियू अत्यधिक संवेदनशील है और आवश्यकता है केवल एक दर्जन से अधिक कोशिकाओं को उत्पन्न करने के लिए एक मजबूत संकेत है. मुंशी समान रिकॉर्डर द्वारा विकसित, डॉ टिमोथी लू एमआईटी में 2014 में की आवश्यकता होती है, "आदेश में" अधिक कोशिकाओं को निकालने के लिए अपेक्षाकृत कमजोर संकेत.

कैमरे के अन्य उपयोगी सुविधाओं है । उपकरण हो सकता है, उदाहरण के लिए, रिकॉर्ड करने के लिए कई संकेतों के साथ-साथ । डेटा भी हो सकता है मिट दवाओं का उपयोग है कि वापसी के अनुपात plasmids के लिए प्रारंभिक स्तर पर है ।

लो प्रभावित है. एक नई नौकरी के लिए, उन्होंने कहा, "वास्तव में महान" और "महत्वपूर्ण" है । हालांकि, किसी भी चिकित्सा का उपयोग की आवश्यकता होगी एक लंबी यात्रा है, इस प्रणाली की मदद कर सकते हैं की पहचान करने के लिए पर्यावरण प्रदूषण या पर नजर रखने के लिए विशिष्ट आणविक संकेतों में परिवर्तित कि स्टेम कोशिकाओं में न्यूरॉन्स, मांसपेशियों या अन्य कोशिका प्रकार है ।

शिकारी वायरस

दो अन्य के अध्ययन के लिए समर्पित के परिवर्तन CRISPR में संवेदनशील नैदानिक उपकरण है ।

DETECTR का लाभ लेता है कम अच्छी तरह से जाना जाता है-भाई Cas9 – Cas12.

के रूप में Cas9, Cas12 गाइड का पालन करें में शाही सेना लक्ष्य और यह कटौती. लेकिन काम की कैंची नहीं बंद कर दिया है । समूह के नेतृत्व के तहत जेनिफर Duddy, आविष्कारक में से एक के CRISPR से कैलिफोर्निया विश्वविद्यालय, बर्कले, अचानक पता चला कि Cas12 सक्रिय रहता है हटाने के बाद, लक्ष्य – वह तुरंत शुरू होता है, शिकार करने के लिए एकल-असहाय डीएनए अणु की कोशिश कर, उन्हें नष्ट करने के लिए.

इस उत्सुक गतिविधि है, शोधकर्ताओं का फैसला किया जोड़ने के लिए नीयन आणविक संकेतों गाइड शाही सेना है कि यह glowed चमकीले हरे सक्रियण के बाद Cas12.

साबित करने के लिए अवधारणा, वैज्ञानिकों का आविष्कार किया है और अधिक गाइड रनस कि बाइंड करने के लिए अलग अलग उपभेदों के मानव पेपिलोमा वायरस (एचपीवी) के कुछ कारण जो गर्भाशय ग्रीवा के कैंसर. प्रणाली DETECTR में सक्षम थे को अलग करने के लिए दो विशेष रूप से खतरनाक तनाव में एचपीवी के एक शोरबा के विभिन्न वायरलउपभेदों.

"यह प्रोटीन कार्य करता है के रूप में एक विश्वसनीय उपकरण का पता लगाने के लिए डीएनए अलग-अलग स्रोतों से कहते हैं," अध्ययन के लेखक जेनिस चेन । "हम चाहते हैं की सीमा बढ़ाने के लिए प्रौद्योगिकी, जो की क्षमता है आवेदन में किसी भी नैदानिक स्थिति है, वहाँ है, जहां एक घटक के डीएनए सहित, कैंसर और संक्रामक रोगों".

रिवर्स साइड है? पेटूपन Cas12 हो सकता है इसके उपयोग की सीमा के उपचार के लिए आनुवंशिक रोगों के मनुष्यों में है । स्टार्टअप Editas पहले से ही लाइसेंस प्राप्त Cas12 आगे के विकास के लिए, और नए वैज्ञानिकों के काम बंद कर सकते हैं अपनी महत्वाकांक्षी योजना है.

फिर भी, डंपिंग Cas12 खातों से यह अभी भी बहुत जल्दी है. जबकि मानव डीएनए खुला हुआ है में एकल असहाय डीएनए (और एक लक्ष्य बन जाता है Cas12), इस एंजाइम मुख्य रूप से जुड़े के साथ जीनोमिक डीएनए. इस सीमा अपनी क्षमता के लिए शिकार करने के लिए संभावित एकल-असहाय पीड़ितों, डॉ फेंग चेन के ब्रॉड संस्थान, लिखा था, जो एक पर काम शर्लक.

शर्लक एक प्रणाली के आधार पर विकसित किया 2017 में विशिष्ट उच्च संवेदनशीलता संवाददाता ताला खोलने – Cas13 का उपयोग करता है के रूप में एक काटने के उपकरण है । पर Cas13 भी एक मोड में हिंसा की जो वह डूब जाता है के बाद के विनाश का मूल लक्ष्य है ।

के मामले में शर्लक जांग और उनके सहयोगियों ने कहा, "बलि" आरएनए अणुओं फेंकना है कि एक संकेत के बाद दरार । की उपस्थिति में वायरल डीएनए या आरएनए उदाहरण के लिए, Zeke, Ebola वायरस हो या डेंगू बुखार – Cas13 काटने वायरल लक्ष्य शाही सेना और बलि, मुक्ति, हालांकि, एक सकारात्मक संकेत है.

शर्लक 2.0, जो वर्णित किया गया था विज्ञान के क्षेत्र में पिछले सप्ताह, 100 गुना अधिक संवेदनशील मूल की तुलना में है, और पता लगाने कर सकते हैं अप करने के लिए चार अलग-अलग लक्ष्य के साथ.

यह भी बहुत ही व्यावहारिक के लिए क्षेत्र का उपयोग करें: सभी अभिकर्मकों कर रहे हैं में एक कागज की पट्टी है, जो डूब में परीक्षण के नमूने. यदि आप पट्टी परीक्षण सकारात्मक वापस आ गया – कोई महंगे उपकरण की जरूरत नहीं रह है.

के रूप में DETECTR, यह शर्लक विशेष रूप से उपयोगी है के दौरान प्रकोप है । प्रौद्योगिकी आसानी से हो सकता है संशोधित करने के लिए ट्रैक अन्य डीएनए अणु रक्त में, उदाहरण के लिए, कैंसर के साथ जुड़े या कोशिकाओं की उम्र बढ़ने.

एक साथ, इस अध्ययन का समर्थन बढ़ती अनुसंधान की प्रवृत्ति का अध्ययन CRISPR अनुप्रयोगों से परे जीन थेरेपी. के साथ तुलना में चिकित्सा के आधार पर CRISPR की आवश्यकता है, जो कई साल की जांचों पर सुरक्षा और प्रभावशीलता के साथ, इन "वैकल्पिक" तरीकों तुम हो सकता है में अनुसंधान और नैदानिक प्रवाह बहुत तेजी से.

हालांकि नए गुर CRISPR परीक्षण की आवश्यकता होती है, विशेषज्ञों आशावादी हैं.

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